Salut!
Abia într-un târziu ¹/, (când) ne-am oprit²/, am înțeles ¹/ (că) taina aceea grea era singurătatea neclintită şi pustie.³/
P² - "când ne-am oprit" - propoziţie subordonată circumstanțială de timp (când am înțeles?);
P³ - "că taina aceea grea era singurătatea neclintită şi pustie." - propoziţie subordonată completivă directă (ce am înțeles?).